然而，去年7月1日環(huán)保產(chǎn)業(yè)開始實施增值稅新政后，眾多企業(yè)普遍的感受卻是稅負不減反增。在過去的300天左右的時間里，環(huán)保企業(yè)試圖通過全國工商聯(lián)政策建議、行業(yè)聯(lián)合建言、人大常委會專題質(zhì)詢，以及媒體喊話等方式，向財政部、國家稅務(wù)總局、發(fā)改委、建設(shè)部和環(huán)保部等相關(guān)部委反映問題。

但是，這些問題在財政部部長樓繼偉看來卻并不是普遍現(xiàn)象。樓繼偉認為環(huán)保業(yè)增值稅新政實施后，總體來看企業(yè)并沒有過多地增加負擔。鑒于第三方治理和PPP模式的推進，越來越多的污水處理企業(yè)已經(jīng)市場化，因此需要增值稅鏈條完整，能夠抵扣，這是環(huán)保業(yè)必須實施營改增的根本原因。

2015年6月12日，財政部和國家稅務(wù)總局印發(fā)了《資源綜合利用產(chǎn)品和勞務(wù)增值稅優(yōu)惠目錄》（財稅[2015]78號）(以下簡稱“78號文”)。文件規(guī)定，自2015年7月1日起，要對污水、垃圾、污泥處置勞務(wù)和再生水征收增值稅，前三者享受退稅比例70%，再生水退稅50%。

此前，污水、垃圾、污泥處置勞務(wù)和再生水一直實行免稅政策，“78號文”的出臺，意味著免稅政策被取消。

文件一出，立刻引發(fā)眾多環(huán)保企業(yè)擔憂。成都市興蓉環(huán)境股份有限公司董事長楊光表示，按照增值稅新政計算，他們企業(yè)當年的增值稅和所得稅凈增加額將達到2800萬元，“將是一個巨大的利空”。“污水處理一向是保本微利的行業(yè)，現(xiàn)在又加上增值稅，一大塊利潤就流掉了。”柏林水務(wù)中國控股有限公司副總經(jīng)理劉阿蕾也表示，環(huán)保行業(yè)要想往前發(fā)展，國家應(yīng)該在政策層面給予支持。

不過，財政部財政科學研究所專家在接受采訪時則表示，要把“78號文”放在完善增值稅制度，形成增值稅完整抵扣鏈條的大背景下來分析，它有利于促進環(huán)保產(chǎn)業(yè)的良性循環(huán)。如果依然延續(xù)免稅政策，企業(yè)就不能獲得進項發(fā)票進行抵扣，長遠看反而會制約污水處理企業(yè)的進一步市場化。

對此，E20環(huán)境平臺首席合伙人傅濤認為，政策出臺的初衷肯定是支持產(chǎn)業(yè)發(fā)展，但由于過去污水處理行業(yè)的交易結(jié)構(gòu)和收費體系中大部分沒有算入增值稅的環(huán)節(jié)，使得增值稅新政加大了產(chǎn)業(yè)的負擔，打破了產(chǎn)業(yè)發(fā)展的均衡。

“78號文”出臺后，環(huán)保產(chǎn)業(yè)一直試圖通過各種途徑，建議主管部門對其進行調(diào)整。

2015年8月21日，環(huán)境商會發(fā)布《關(guān)于完善污水垃圾處理行業(yè)增值稅政策的建議》，建議針對污水垃圾處理存量項目制定過渡期政策，降低污水垃圾處理增值稅稅率，明確返還時間，退還相關(guān)附加收費。同時，還應(yīng)在污水垃圾處理行業(yè)全產(chǎn)業(yè)鏈完善營改增政策。

該建議顯示，2014年污水垃圾處理整體收益率一般僅為8%-10%，根據(jù)對2014年全國污水處理行業(yè)281家規(guī)模以上企業(yè)的財務(wù)分析，有57家出現(xiàn)虧損，占比20%，虧損金額達3.84億元。而實施增值稅新政后，污水垃圾處理行業(yè)整體收益率將再下降兩個百分點，意味著在原來微利的基礎(chǔ)上又減少了一部分利潤。

幾乎同時，E20環(huán)境平臺也聯(lián)合30余家環(huán)境企業(yè)發(fā)布了《關(guān)于<資源綜合利用產(chǎn)品和勞務(wù)增值稅優(yōu)惠目錄>的建議》，提出免征或低稅率征收增值稅、區(qū)分新老項目進行征收、明確“即征即退”的時間限定、即征即退的增值稅免征所得稅、增加政策實施緩沖期、出臺實施細則、啟動地方水價調(diào)價及補貼機制和完善處罰制度等8項建議。

2015年8月29日，在十二屆全國人大常委會第十六次會議聯(lián)組會議上，全國人大常委王毅也曾就此問題專門向樓繼偉詢問相關(guān)情況，財政部給出的解釋則是營改增是推進環(huán)保企業(yè)向市場化、專業(yè)化轉(zhuǎn)型的重要工具。“出臺這個政策的時候我們財稅兩家是經(jīng)過廣泛的調(diào)研，也算了賬，總體上說財政可能會減收。”樓繼偉說，“目前有一些叫苦的，主要是市政單位，因為他們不專業(yè)化運作，沒有開增值稅發(fā)票的需求，直接就排掉了，而且長期享受免稅政策，這些單位目前對政策調(diào)整還不太適應(yīng)。”

針對樓繼偉的回答，E20環(huán)境產(chǎn)業(yè)研究院執(zhí)行院長薛濤表示，“78號文”實際并沒有起到樓繼偉所說“鼓勵市政設(shè)施運營的市場化轉(zhuǎn)型”的目的，污水處理企業(yè)一般都已跟政府簽訂了固定的價格，本次稅負調(diào)整后想從政府獲得價格補償非常困難。在PPP落地難的背景下，“78號文”將挫傷社會資本對政府契約精神的信心和合作意愿。

目前，“78號文”已經(jīng)實施9個多月，有企業(yè)反映，部分地區(qū)存在“只征不返”或返稅不及時的現(xiàn)象。

今年1月，E20環(huán)境平臺發(fā)起“78號文增值稅收繳、返還情況”的調(diào)查。結(jié)果顯示，確有部分地區(qū)存在未返還或返還不及時的情況。例如，由于“78號文”的目錄對工業(yè)固廢列舉不全面，結(jié)果導致一些地方稅務(wù)機關(guān)對目錄中未列舉的工業(yè)固廢品類不予享受增值稅退稅70%的政策，使得企業(yè)最終實際稅負高達16.5%左右，成本大幅增加。

此外，也有部分城市的稅務(wù)工作人員由于對新的文件政策不熟悉，或是業(yè)務(wù)不熟練等原因，導致增值稅退稅70%返稅不及時，影響到了環(huán)保企業(yè)的現(xiàn)金流，以及項目的再投資。

“整體來講，中國的污水處理服務(wù)費大約比實際成本低了10%，本來水價就沒到位，78號文實施后更是雪上加霜。”碧水源董秘何愿平表示。

4月12日，國務(wù)院新聞辦就全面推開營改增試點有關(guān)情況舉行吹風會，國家稅務(wù)總局副局長汪康表示，增值稅對核算的要求很高，如果企業(yè)操作得規(guī)范，運用得好稅負就會下降；但如果企業(yè)仍是粗放式管理、不規(guī)范運作，稅負就不能保證一定是下降，因為該抵扣的不能享受到抵扣。

財政部副部長史耀斌也表示，財政部、國家稅務(wù)總局已經(jīng)要求所有財稅干部幫助培訓企業(yè)的財務(wù)人員，理解好如何在新的增值稅機制之下申報納稅，以免出現(xiàn)誤解、誤判或者人為制造出一些稅負增加的情況。